开始的时候日本短尾猫会到处大小便，那么主人应该将它的大便放在猫砂盘上浅埋起来，这是告诉小猫：它应该在这里上厕所。刚训练时可以在小猫活动的地方垫上报纸，以防万一。当小日本短尾猫吃饱十五分钟后，将日本短尾猫放在猫砂盘上，提醒它上厕所。开始时的猫砂盘不要高过一个英寸(2.5CM)，以方便小猫出入。如果日本短尾猫总是到外面大小便，你可以观察到日本短尾猫都是去比较固定的地方。这时主人可以用一个小盘装些猫砂放在那个地方，猫砂的味道会诱使日本短尾猫进去大小便，那么主人可以每天慢慢移动这个盘的位置，直至到达猫砂盘的地方。这个过程中日本短尾猫已经适应猫砂而且养成大小便要上猫砂盘的习惯了。