猫病毒性上呼吸道感染通常是由两种病毒引起的，但仅凭一些临床症状很难区分是哪种病毒引起的。但只要有选择性治疗，是否能区分病因并没有太大影响。

适用于患有病毒性上呼吸道感染、FHV-1或FCV感染的幼猫。治疗主要集中在是否提供良好的护理、能量、输液和抗菌治疗以应对继发性细菌感染。脱水导致分泌物加重和呼吸困难。最好通过口供液，而不是无肠输血。鼻饲有助于为生病的猫提供能量。目前nt，没有针对生病猫的抗病毒治疗。阿昔洛韦是一种流行的抗疱疹病毒药物，已被发现对FHV-1无效。

对于FHV-1引起的溃疡性角膜炎猫，可使用眼科用三氟化钠（1%溶液），每4小时一次，直到临床症状缓解1周。人用局部抗凝剂可用于猫的短期缓解治疗。长期使用这些药物会导致鼻腔充血和反弹，导致呼吸困难。如果提供支持性护理，感染的恢复是理想的。在没有治疗的情况下，大多数感染在10-14天内是自限的，但继发性细菌感染会加重病情。P肺炎对幼猫是有害的，特别是当支气管败血症博德特菌存在时，可导致感染小猫的高死亡率。预后取决于慢性细菌携带者的发展和临床症状。FCV与重要的上呼吸道疾病和口腔疾病长期带菌状态有关。

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